Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Clip2Q9Z0H8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Clip2Q9Z0H8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Clip2Q9Z0H8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip2Q9Z0H8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Clip2Q9Z0H8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms