Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms