Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms