Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sema6cQ9WTM3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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