Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms