Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.9 ms