Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nek3Q9R0A5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nek3Q9R0A5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nek3Q9R0A5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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