Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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