Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms