Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms