Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh11Q9QYF1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh11Q9QYF1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms