Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms