Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms