Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms