Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms