Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prg4Q9JM99 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Prg4Q9JM99 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Prg4Q9JM99 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Prg4Q9JM99 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Prg4Q9JM99 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Prg4Q9JM99 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prg4Q9JM99 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prg4Q9JM99 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prg4Q9JM99 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prg4Q9JM99 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms