Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms