Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prg3Q9JL95 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prg3Q9JL95 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prg3Q9JL95 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms