Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hmgn5Q9JL35 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hmgn5Q9JL35 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hmgn5Q9JL35 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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