Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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