Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1fQ9JIS7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms