Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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