Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER05

Ctrl, Chymopasin, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtrlQ9ER05 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CtrlQ9ER05 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CtrlQ9ER05 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms