Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms