Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Syde1Q9DBZ9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Syde1Q9DBZ9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Syde1Q9DBZ9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syde1Q9DBZ9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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