Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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