Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms