Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms