Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms