Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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