Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Subh2bvQ9D9Z7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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