Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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