Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms