Protein–RNA interactions for Protein: Q9D819

Ppa1, Inorganic pyrophosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppa1Q9D819 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ppa1Q9D819 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ppa1Q9D819 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms