Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9D7E4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms