Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pfn4Q9D6I3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms