Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
4933428G20RikQ9D3X4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms