Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snx29Q9D3S3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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