Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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