Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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