Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms