Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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