Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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