Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrrc17Q9CXD9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrrc17Q9CXD9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc17Q9CXD9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrrc17Q9CXD9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrrc17Q9CXD9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrrc17Q9CXD9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lrrc17Q9CXD9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc17Q9CXD9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lrrc17Q9CXD9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc17Q9CXD9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc17Q9CXD9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lrrc17Q9CXD9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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