Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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