Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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