Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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