Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms