Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc5Q9CQA1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms