Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms